污水的处理流程中，污水经过一级处理后，流入主体工艺A2/O生物池内，在生物池的不同工段里的各种微生物新陈代谢作用下，能够对污水中的有机物进行降解和去除，同时达到使污水脱氮除磷的目的。
A2/O工艺生物池主要经以下四个工段处理污水。
选择池：在经A2/O工艺处理污水前，污水先流经选择池，在选择池内利用生物竞争机制能够有效抑制丝状菌的过度繁殖和生长，以此控制污水处理过程中污泥膨胀的发生以及发展；同时前置选择池属于缺氧环境，这种环境适合反硝化细菌的生长，对污水起着脱氮作用，还能减弱硝酸盐对厌氧池产生的各种不良影响，为厌氧池中的释磷微生物创造有利的生长环境。
厌氧池：厌氧池中无曝气装置，且流入厌氧池的污水中污染物的浓度较高，水体中的溶解氧因分解消耗几乎用尽，适宜厌氧环境的微生物产生活动从而处理水中的污染物。厌氧池的原理主要是利用厌氧菌的作用，使污水中的有机物发生水解、酸化以及甲烷化，使污水中的有机物能够去除，污水的可生化性提高，对后续的好氧处理更有利。
缺氧池：缺氧池内的污染物含量已经降低，池中水体适合好氧和兼氧微生物生活。反硝化菌在缺氧环境中，同时碳源充足的条件下可以将污水中的硝酸盐氮等转化为氮气排到大气中，起到生物脱氮的作用。缺氧池的主要作用就是配合好氧池使污水脱氮除磷，原理主要是将水中的大分子有机颗粒分解为小分子颗粒，提高废水的可生化性，主要用于好氧池的前处理。
好氧池：通过曝气等措施维持水中的溶解氧含量，使适合好氧环境的微生物生长繁殖，从而去除污水中的污染物质。主要作用是使池中的活性污泥进行有氧呼吸，能进一步分解水中的有机物，去除水中的污染物。
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