医院污水处理方式的选择主要是受污水来源、污水流向、以及当地的实际供水情况等多方面因素的影响，但是无论采用哪种处理方式，在医院污水的处理流程中非常重要的一点，就是必须要将污水进行消毒处理。因为在医院污水中通常含有大量的病毒、细菌和虫卵等致病病原体，还有化学药剂和放射性元素的污染，污水具有一定的空间传染、急性传染和潜伏性传染的性质，对周围环境和人体造成的危害较大。在医院污水的处理工艺中，进行消毒处理的主体可以采用臭氧消毒，臭氧消毒的杀菌机理主要是通过破坏和氧化水中微生物的细胞膜、细胞质、以及酶系统和核酸的方式，将细菌和病毒等病原体迅速灭活。研究发现臭氧消毒在医疗机构污水处理的实际应用中，杀灭水中病原性微生物、细菌和病毒等的效率高达99%以上，且不会对周围的环境造成二次污染，还可以长时间的连续进行工作。将经过臭氧消毒处理后的废水提升至工艺中的过滤系统中进行进一步的过滤净化处理后，污水就可以达标排放。

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